Hallo erstmal,
es ist durchaus nicht ungewöhnlich, wenn die Schwanzfedern der Wellensittiche unterschiedlich lang sind. Das hängt damit zusammen, dass Wellensittiche von Zeit zu Zeit ihr Federkleid erneuern müssen und dass deshalb ausgefallene Federn zunächst mal kürzer sind als vorher.
Abschneiden sollte man die Federn nicht, wenn es nicht unbedingt medizinisch notwendig wäre. Der Wellensittich spürt da (zumindest wenn man nicht direkt am Folikel schneidet) zwar keine Schmerzen, aber die Federn hat er ja nicht grundlos.
Dass eine Feder nach dem Abschneiden noch nachwächst kann eben mit der Mauser zusammen hängen. Aber gefördert wird das Wachstum dadurch keinesfalls.
Zu der Sache mit den zwei Hennen: In aller Regel vertragen sich zwei Hennen nur als Jungvogel. Werden sie das erste Mal brutig, werden sie sehr wahrscheinlich zickig werden und es kommt zu Rivalitäten, die nicht selten in blutigen Kämpfen münden.
Ich würde vorschlagen, die beiden diesbezüglich gut zu beobachten und zu trennen, sobald sich erste Anzeichen eines Streits bemerkbar machen. Eine Alternative zur Trennung (die übrigens nicht bloß ein paar Tage notwendig wäre) ist die Anschaffung von zwei Hähnen. Das sorgt für Ausgeglichenheit.
Falls Du nicht sicher bist, ob es wirklich Hennen sind: Stelle ein Foto vom Kopf, speziell der Wachshaut und des Schnabels in den Bestimmungsthread.