Hast du denn jetzt, wenn du mit der Zucht beginnen willst, schon verwandte, gegengeschlechtliche Tiere?
Wenn nicht, dann hat sich, bis die Nachzuchten geschlechtsreif sind, das Thema der Inzucht erstmal erledigt.
Falls doch, und du nicht trennen willst, gehe ich jetz mal davon aus, dass du weißt, wer mit wem verwandt ist.
Dann kannst du Inzucht insofern (fast!) vermeiden, dass du die Eier der Inzuchtpaare schlichtweg gegen Kunsteier austauschst oder abkochst. Um dem Paar dennoch das Gefühl des Erfolgs zu geben, kannst du ja befruchtete Eier eines normalen Paares unterlegen.
Bei nicht zu vielen Brutpaaren sollte man da schon den Überblick behalten können und das Risiko beträchtlich eingrenzen.
Eine Garantie dafür, dass das Ei der Henne A auch von Hahn A befruchtet wurde gibts natürlich nicht, es kann immer gut sein, dass zwischendurch auch ein anderer hahn aufspringt, der mit henne A verwandt ist und schon hast du Inzucht. Um das auszuschließen bleibt dir nur die Trennung der miteinander verwandten Tiere.