Hallo,
Die Hühner sind sicher nicht übers Futter gegen Kokzidien geimpft, Aufzuchtfutter enthält aber häufig ein Kokzidiostatika, dieses darf maximal bis zur Legereife verfüttert werden. Sobald man das Futter absetzt, ist der Schutz vorbei. Es gibt auch eine Impfung, die wird aber über das Trinkwasser verabreicht, die sollte aber nicht gleichzeitig mit dem kokzidiostatikahaltigen Aufzuchtfutter verabreicht werden.
Mit Zwiebeln allein kann man keine Hühner entwurmen. Übermäßig verfüttert sollen Zwiebeln bei Hühnern allerdings zu Blutarmut und sogar zum Tod führen können.
Abwarten ist immer die ungeschickteste Lösung. Vor allem dürfte es über die Feiertage mit Laboruntersuchungen und Tierarzt nicht so einfach werden. Außerdem hast du ja offenbar einen großen Geflügelbestand, da würde ich bei Verdacht auf Erkrankungen schnell reagieren, um einer kompletten Durchseuchung vorzubeugen.
Viele Grüße